Blíží se doba e-fakturace. Konečně! V některých zemích EU už povinnost vystavovat a přijímat elektronické faktury nařizuje zákon, od ledna 2027 se přidá dokonce i Slovensko. V článku se dozvíte, jaká pravidla platí pro podnikatele v ČR a co se v rámci digitalizace chystá v nejbližších letech. Rychlou odpověď, jestli musíte svou fakturaci digitalizovat, najdete hned na začátku.
Obsah článku
Rychlé shrnutí: Kdo musí vystavovat e-faktury?
- V ČR zatím nemusíte používat faktury v elektronické podobě. Pokud si chcete urychlit práci a snížit chybovost, začněte dobrovolně. Stačí, aby s elektronickou fakturou souhlasili vaši odběratelé.
- Na Slovensku bude e-fakturace povinná od 1. 1. 2027. Českých podnikatelů se týká jen tehdy, když tam mají provozovnu nebo dceřinou firmu.
- 1. 7. 2030 začne pro přeshraniční obchody mezi firmami (B2B) v rámci celé EU platit povinnost vystavovat a přijímat e-faktury.
- Strukturované e-faktury (např. Peppol BIS) se načtou do fakturačního, účetního nebo ERP systému bez ručního přepisování. To obyčejné PDF neumí.
- Připravit se můžete už teď. Fakturoid nyní ke každé faktuře přidává ISDOC a odesílání přes Peppol připravuje.

Týká se vás povinná digitalizace faktur?
Čistě českých podnikatelů se zatím povinnost digitalizovat fakturaci netýká. V ČR mají ze zákona povinnost elektronické faktury přijímat jen veřejné instituce. Do e-fakturace se však můžete pustit dobrovolně. A to je za nás vždycky lepší než pod tlakem státního nařízení. 🙂
Nejbližší datum, které se přímo týká českých B2B podnikatelů, je 1. 7. 2030. Od toho dne budou plátci DPH i identifikované osoby povinně vystavovat a přijímat strukturované e-faktury při obchodování s firmami z jiných zemí EU. Kdo fakturuje jen koncovým spotřebitelům (B2C), nemusí v nejbližších letech řešit vůbec nic. Ale pokud podnikáte na Slovensku, máte nejvyšší čas vybrat si „digitálneho poštára“ 👇
Co se změní na Slovensku od 1. 1. 2027?
Od 1. 1. 2027 musí podle novely zákona o dani z pridanej hodnoty slovenští plátci DPH u obchodů na Slovensku vystavovat e-faktury firmám i státu. Přijímat je musí umět každý slovenský podnikatel a každá právnická osoba, i když nejsou plátci DPH. Faktury pro koncové zákazníky se nemění. Výjimky platí třeba pro plnění osvobozená od DPH nebo zjednodušené faktury.
Slovenské firmy budou e-faktury posílat přes síť Peppol ve formátu podle normy EN 16931. Doručovat je bude certifikovaný poskytovatel, kterému se na Slovensku říká digitálny poštár. Ten zároveň předá údaje z faktury finanční správě.
Pro české firmy je slovenská povinnost důležitá, když:
- mají na Slovensku stálou provozovnu a jsou tam proto plátci DPH,
- mají na Slovensku dceřinou společnost – ta má stejné povinnosti jako každá slovenská firma.
Takže jestli fakturujete z Česka slovenským firmám, tahle povinnost se vás netýká, ani když jste na Slovensku registrovaní k DPH jako zahraniční osoba bez provozovny. Fakturujete stejně jako dosud podle pravidel v článku o fakturaci na Slovensko.

Jak se liší elektronická faktura a strukturovaná e-faktura?
Elektronická faktura je pro většinu lidí PDF v e-mailu. Pro český zákon o DPH to elektronická faktura opravdu je. Povinná digitalizace ale míří na strukturovanou e-fakturu ve formátu podle evropské normy EN 16931 (nejčastěji Peppol BIS).
Hlavní rozdíl je v tom, že klasické PDF je dobře čitelné pro člověka, ale účetní nebo fakturační software ho bez vytěžovacího nástroje nepřečte. Strukturovaná e-faktura je soubor s daty, kterou si fakturační, účetní nebo ERP program načte sám, bez překlepů, chyb a vynechaných polí.
Co platí pro elektronickou fakturaci v ČR?
Pro elektronickou fakturaci v České republice podle § 26 zákona o DPH platí, že s elektronickou podobou musí souhlasit odběratel. Finanční správa připouští i tichý souhlas – třeba tím, že odběratel fakturu zaúčtuje. Které údaje na e-faktuře nesmí chybět, se dozvíte v článku o náležitostech elektronické faktury.
V ČR je vedle klasického PDF nejrozšířenější formát elektronických faktur ISDOC. Jde o český standard, o který přijímají i české úřady. Za hranicemi ale s ISDOC moc nepochodíte a ani evropská norma pro e-faktury s ním nepočítá.

Co je Peppol a jak se liší od ISDOC?
Peppol (Pan-European Public Procurement OnLine) je mezinárodní síť pro výměnu strukturovaných dokladů (faktur, dobropisů, objednávek i dodacích listů). Firmy se do ní připojují přes certifikované poskytovatele, takzvané přístupové body. Funguje to podobně jako e-mail – ke schránce se taky připojujete přes poskytovatele, třeba Gmail.
Faktury v síti Peppol mají formát Peppol BIS Billing 3.0. Ten vychází z evropské normy EN 16931, kterou v Česku oblíbený ISDOC nesplňuje.
ISDOC vyřešil, jak mají data na faktuře vypadat, aby je program načetl. Elektronická fakturace ale není jen o tom, že místo PDF pošlete XML soubor. Peppol řeší i to, co ISDOC neumí:
- potvrzení o doručení – faktura nezapadne ve spamu a víte, že dorazila
- odpověď odběratele – ten může dát vědět, že fakturu přijal
- navazující doklady – v síti Peppol se předávají i objednávky a dodací listy
Rozdíly mezi PDF, ISDOC a Peppol přehledně (tabulka)
| Vlastnost | ISDOC | Peppol BIS | |
|---|---|---|---|
| Čitelnost pro účetní software | ne | ano | ano |
| Způsob doručování | e‑mail | webfaktura, ISDOC.PDF e‑mailem | sítí Peppol |
| Rozsah používání | všude | hlavně v Česku | Slovensko a další země EU i mimo ni |
| Soulad s EN 16931 | ne | ne | ano |
Jak se zapojit do sítě Peppol v Česku?
Česko nemá vlastní národní autoritu pro Peppol, takže tu platí pravidla mezinárodní organizace OpenPeppol, která síť spravuje. Nejjednodušší cesta vede přes fakturační program, který s poskytovatelem spolupracuje. Ve Fakturoidu se odesílání faktur přes Peppol právě připravuje.

Jak s e-fakturací souvisí evropská směrnice ViDA?
ViDA je zkratka z anglického VAT in the Digital Age, česky DPH v digitálním věku. EU ji přijala v březnu 2025 a cílem je hlavně boj s daňovými podvody. Pro podnikatele je klíčové datum 1. 7. 2030. Od toho dne začnou pro obchody mezi firmami z různých zemí EU platit nové povinnosti:
- Fakturace bude probíhat výhradně elektronicky podle evropské normy, PDF už stačit nebude.
- Čas na vystavení faktury budete mít do 10 dnů od uskutečnění obchodu.
- Údaje z faktury se digitálně nahlásí finanční správě a tohle hlášení nahradí dnešní souhrnné hlášení.
ViDA zároveň dovoluje každému státu zavést povinnou e-fakturaci i pro tuzemské obchody. Toho využilo právě Slovensko a před ním např. Itálie (2019), Belgie (2026) nebo Polsko (2026). Na internetu se často objevuje tvrzení, že od roku 2035 bude e-faktura povinná pro všechny faktury v EU. Rok 2035 je ale jen termín, do kterého musí státy s vlastním systémem hlášení faktur sladit pravidla s Evropou.

Jak se na e-fakturaci připravit?
I když vás zákon zatím k ničemu nenutí, s digitalizací faktur se vyplatí začít už teď. Tady je 5 důvodů:
- Vyhnete se chybám z přepisování.
- Všechny doklady budete mít uložené na bezpečném a vždy dostupném místě.
- Účetní si doklady kdykoliv exportuje a nahraje do svého účetního programu.
- Ušetříte čas třeba díky automatickému párování plateb.
- Až vám to nařídí zákon, budete připraveni.
Vyberte si spolehlivý fakturační program, protože faktury z Excelu nebo Wordu strukturovaná data neobsahují. Například ve Fakturoidu má každá faktura datovou vrstvu ISDOC. Odesílání přes Peppol fakturační robot připravuje.
V článku o digitalizaci účetních dokladů se dozvíte, jak do digitální podoby převést i přijaté faktury a účtenky.
Tip: Fakturujete zatím v Excelu nebo ve Wordu? Teď je dobrý čas na změnu. Vyzkoušejte Fakturoid zdarma – fakturu vystavíte do minuty.
Časté otázky
Musí OSVČ vystavovat elektronické faktury?
Dnes ne. Pokud fakturujete jen v Česku, můžete posílat PDF i papírové faktury. Povinnost přijde od 1. 7. 2030 jen pro OSVČ, které jsou plátci DPH nebo identifikovanými osobami a fakturují firmám v jiných zemích EU. Pro čistě české faktury zatím žádné datum neexistuje.
Týká se povinná digitalizace faktur i neplátců DPH?
Neplátce, který fakturuje jen v Česku, se zatím netýká. Pozor ale na služby pro firmy z EU. Když jako neplátce fakturujete takovou službu, stáváte se identifikovanou osobou a od 1. 7. 2030 se vás pravidla pro e-fakturaci týkají stejně jako plátců DPH.
Stačí faktura v PDF poslaná e-mailem?
V Česku ano, pokud s tím odběratel souhlasí – stačí i tichý souhlas. Pro obchody s firmami v jiných zemích EU ale od 1. 7. 2030 budete potřebovat strukturované e-faktury.
Musím mít ISDOC, nebo Peppol?
V Česku nemusíte mít ani jedno. ISDOC je český formát faktury, který si účetní programy načtou samy. Peppol je síť pro doručování e-faktur ve formátu Peppol BIS. Budete ho potřebovat hlavně při obchodech na Slovensku nebo když si ho vyžádá odběratel. Od roku 2030 se bude hodit i pro faktury firmám napříč EU.
Potřebuji k elektronické faktuře elektronický podpis?
Ne. Podpis nemusí mít ani papírová faktura. U daňových dokladů musíte umět doložit, že faktura je opravdu od vás, nikdo ji po odeslání nezměnil a dá se přečíst (zákon tomu říká věrohodnost původu, neporušenost obsahu a čitelnost). Většině podnikatelů k tomu stačí, že faktura sedí k objednávce, smlouvě a platbě na účet.
Co když fakturuji zákazníkům na Slovensko?
Pokud fakturujete z Česka, slovenská povinnost od roku 2027 se vás netýká. Fakturujete stejně jako dosud a e-fakturu pošlete, jen když o ni odběratel požádá. Jiná situace je, když máte na Slovensku stálou provozovnu nebo dceřinou společnost.
Pozor
Článek jsme aktualizovali v říjnu 2026 a vychází z platných předpisů – konkrétně ze zákona o DPH, zákona o zadávání veřejných zakázek, směrnice Rady EU 2025/516, slovenského zákona o DPH a informací Evropské komise, Ministerstva financí ČR a Finančnej správy SR.